知名舞台剧女演员牧树里这日收到怪盗基德的预告信：在26个字母的盘旋飞舞中，他来拜领无价的“命运的宝石”。毛利小五郎受到牧树里委托将信件分析，认为基德将在演出最后一晚前来盗取宝石，当晚他及柯南、小兰等人来到剧场，那里早有诸多警察守候。 令柯南吃惊的是，基德竟扮成工藤新一出现在众人面前，但他及众人方向不同的紧张过后，宝石并没被盗，柯南醒悟字母预告信与航班相关。而柯南、小兰、牧树里及其同事搭乘的前往北海道的飞机上，尚有一起杀人计划正被精心设计。
猪迪克带着自己的精灵宠物豆包在海上冒险，因为一场海难，猪迪克与豆包走散。为了寻回豆包，猪迪克不得不独自面对困难。他漂泊在海上意外遇到了出海寻找海魂心的女孩--浅蓝族长，之后他们一起经历了遗忘岛上的奇幻冒险、寻回了走失的浅蓝弟弟--尾牙，猪迪克最终也找到了精灵伙伴豆包，获得成长。
